O que geralmente acontece é que originalmente existe uma estação chamada X (que pode ou não ter o nome da cidade onde está localizada). Em algum momento é decidido que a área precisa de uma nova estação, e que a nova estação deve ser chamada apenas de “Shin-X”, que deve ser entendida como “o novo X”.
Algumas vezes a razão pela qual uma nova estação é necessária é que uma nova linha Shinkansen para a área é planejada e é determinado que a estação existente não é adequada para acomodá-la. Isto é o que aconteceu em Shin-Osaka, por exemplo: a área ao redor da estação de Osaka não tinha espaço suficiente para os desenvolvimentos necessários.
No entanto, pode haver muitas outras razões pelas quais uma nova estação é necessária. No caso de Shin-Sapporo, foi para servir um novo desenvolvimento urbano (que por acaso também foi chamado Shin-Sapporo). Um interessante é Shin-Rifu (na cidade de Rifu, perto de Sendai) que foi estabelecida quando o Tohoku Shinkansen começou a funcionar, não porque o Shinkansen realmente vai para esta estação, mas para acomodar funcionários e visitantes do pátio ferroviário vizinho de Shinkansen. A página wikipedia japonesa de uma estação normalmente tem uma secção “História” onde é dada alguma informação sobre o seu estabelecimento.
E por vezes Shin é apenas parte do nome “actual” da estação, como acontece na estação Shintoku (na cidade de Shintoku, Hokkaido).